PG: больше соответствие SQL-стандарту, оконные функции, CTE, рекурсивные запросы, типы (JSONB, array, custom), расширения, строгая консистентность по умолчанию. MySQL: проще администрирование, широкое распространение в хостингах, репликация из коробки. PG часто выбирают для сложной логики и аналитики; MySQL - для типичного веб-приложения. Оба поддерживают ACID, индексы, репликацию.